Skip to main content

Table 1 List of the 14 core and 14 dominant phycosphere genera

From: Epiphytic common core bacteria in the microbiomes of co-located green (Ulva), brown (Saccharina) and red (Grateloupia, Gelidium) macroalgae

Taxa

Relative abundance (AVERAGE ± STDEV) (number of MAGs/draft genomes/cultured strains)

Genus

Gelidium sp. (H)

Grateloupia sp. (R)

Ulva sp. (L)

Saccharina sp. (B)

Seawater (S)

Sediment (N)

Saprospiraceae unca

(3.96 ± 3.16) (35/-/-)

(10.15 ± 4.27) (39/-/-)

(4.28 ± 2.39) (47/-/-)

(1.79 ± 2.96) (4/-/-)

(0.08 ± 0.05) (-/-/-)

(0.2 ± 0.14) (4/-/-)

Portibactera

(1 ± 0.96) (-/-/-)

(3.79 ± 1.59) (1/-/-)

(1.21 ± 1.13) (-/-/-)

(0.43 ± 0.72) (-/-/-)

(0.02 ± 0.03) (-/-/-)

(0.05 ± 0.04) (-/-/-)

Lewinellaa

(0.96 ± 1.36) (1/-/-)

(0.65 ± 0.64) (1/-/-)

(2 ± 2.28) (3/-/-)

(0.88 ± 1.16) (-/-/-)

(0.01 ± 0.02) (-/-/-)

(0.03 ± 0.03) (-/-/-)

Algitaleaa

(8.9 ± 11.7) (-/-/1)

(1.44 ± 1.17) (-/3/33)

(15.07 ± 13.44) (-/3/42)

(1.36 ± 0.62) (-/1/4)

(0.08 ± 0.06) (-/-/1)

(0.07 ± 0.07) (-/-/-)

Microtrichaceae unca

(2.24 ± 1.95) (1/-/-)

(4.49 ± 2.57) (23/-/-)

(4.89 ± 6.18) (19/-/-)

(0.46 ± 0.58) (5/-/-)

(0.03 ± 0.04) (1/-/-)

(0.11 ± 0.1) (-/-/-)

Sva0996 marine groupa

(1.97 ± 2.74) (-/-/-)

(9.23 ± 7.87) (5/-/-)

(4.89 ± 6.03) (1/-/-)

(0.64 ± 0.74) (1/-/-)

(0.27 ± 0.16) (5/-/-)

(0.28 ± 0.19) (-/-/-)

Rubritaleaa

(2.06 ± 4.24) (1/-/-)

(0.62 ± 0.53) (-/-/-)

(1.02 ± 1.51) (1/-/-)

(24.37 ± 31.1) (1/-/-)

(0.13 ± 0.2) (-/-/-)

(0.04 ± 0.06) (-/-/-)

Rhizobiaceae unca

(1.53 ± 1.64) (6/-/-)

(5.97 ± 3.34) (6/-/-)

(9.63 ± 14.93) (4/-/-)

(0.56 ± 0.83) (-/-/-)

(0.1 ± 0.11) (-/-/-)

(0.11 ± 0.13) (-/-/-)

Robiginitomaculuma

(1.22 ± 1.97) (2/-/1)

(0.56 ± 0.7) (-/-/-)

(0.32 ± 0.59) (4/-/-)

(0.38 ± 0.49) (-/-/-)

(0.01 ± 0.02) (-/-/-)

(0.01 ± 0.01) (-/-/-)

Helleaa

(7.45 ± 5.81) (-/1/2)

(3.08 ± 2.19) (-/-/-)

(4.69 ± 3.82) (2/-/-)

(0.49 ± 0.65) (2/-/-)

(0.11 ± 0.1) (3/-/-)

(0.11 ± 0.13) (-/-/-)

Rhodobacteraceae unca

(2.32 ± 3.34) (9/-/-)

(3.99 ± 1.68) (8/-/-)

(3.45 ± 3.23) (13/-/-)

(0.49 ± 0.55) (1/-/-)

(0.19 ± 0.11) (7/-/-)

(0.1 ± 0.06) (3/1/-)

Sulfitobactera

(0.68 ± 0.7) (2/3/26)

(0.97 ± 0.7) (1/1/18)

(0.64 ± 0.53) (-/7/39)

(1.04 ± 0.97) (-/3/38)

(4.52 ± 5.11) (1/-/2)

(0.07 ± 0.07) (-/2/17)

Granulosicoccusa

(7.55 ± 12.59) (5/2/5)

(7.84 ± 7) (1/-/1)

(4.32 ± 3.13) (8/-/-)

(11.65 ± 13.11) (4/1/4)

(0.13 ± 0.08) (-/-/1)

(0.22 ± 0.15) (-/-/-)

Leucothrixa

(1.69 ± 2.39) (-/-/-)

(1.13 ± 1.33) (1/-/-)

(2.81 ± 4.56) (1/-/-)

(3.1 ± 3.31) (1/-/2)

(0.04 ± 0.05) (-/-/-)

(0.05 ± 0.08) (-/-/-)

Trueperab

(2.12 ± 3.68) (-/-/-)

(1.74 ± 1.9) (-/-/-)

(2.91 ± 5.18) (-/-/-)

(0.15 ± 0.18) (-/-/-)

(0.01 ± 0.01) (-/-/-)

(0.18 ± 0.12) (-/-/-)

Rubidimonasb

(0.69 ± 0.82) (-/-/-)

(0.71 ± 0.75) (-/-/-)

(2.08 ± 1.98) (3/-/-)

(0.28 ± 0.36) (-/-/-)

(0.01 ± 0.01) (-/-/-)

(0.01 ± 0.02) (-/-/-)

Maribacterb

(0.83 ± 0.65) (4/1/21)

(1.41 ± 1.32) (6/18/81)

(0.31 ± 0.17) (2/8/27)

(1.13 ± 1.48) (1/5/31)

(0.02 ± 0.02) (-/2/2)

(0.12 ± 0.08) (-/2/10)

Tenacibaculumb

(0.75 ± 1.76) (-/11/27)

(0.09 ± 0.08) (1/12/46)

(0.31 ± 0.35) (2/7/56)

(3.37 ± 3.01) (1/1/6)

(0.06 ± 0.08) (-/-/1)

(0.03 ± 0.05) (-/-/14)

Aquimarinab

(0.29 ± 0.52) (5/17/87)

(0.49 ± 0.7) (3/37/236)

(0.05 ± 0.08) (8/10/38)

(0.37 ± 0.44) (-/-/14)

(0.01 ± 0.01) (-/-/1)

(0.03 ± 0.04) (-/-/1)

Roseibacillusb

(6.08 ± 10.53) (3/-/-)

(4.57 ± 4.83) (1/-/-)

(0.35 ± 0.79) (-/-/-)

(0.05 ± 0.06) (-/-/-)

(0.03 ± 0.02) (-/-/-)

(0.07 ± 0.04) (-/-/-)

Erythrobacterb

(0.41 ± 0.73) (-/10/60)

(0.47 ± 0.62) (-/6/40)

(0.53 ± 0.73) (5/14/53)

(0.36 ± 0.56) (1/7/22)

(0 ± 0.01) (-/-/1)

(0.03 ± 0.03) (-/1/15)

Pseudahrensiab

(0.66 ± 0.82) (-/-/1)

(0.51 ± 0.3) (-/-/-)

(0.27 ± 0.23) (-/-/-)

(0.63 ± 0.86) (-/-/-)

(0.02 ± 0.02) (-/-/1)

(0.09 ± 0.05) (-/-/-)

Hyphomonadaceae uncb

(2.41 ± 3.1) (3/-/-)

(0.65 ± 0.47) (-/-/-)

(0.55 ± 0.99) (-/-/-)

(0.25 ± 0.37) (-/-/-)

(0.03 ± 0.04) (-/-/-)

(0.01 ± 0.01) (-/-/-)

Celeribacterb

(0.23 ± 0.38) (-/-/-)

(1.43 ± 1) (-/-/-)

(1.21 ± 1.71) (1/-/-)

(0.98 ± 1.13) (-/-/-)

(0.03 ± 0.04) (-/-/7)

(0.02 ± 0.03) (-/-/1)

Planktotaleab

(0.61 ± 1.02) (-/-/1)

(1.41 ± 1.22) (-/-/-)

(1.28 ± 1.47) (-/-/-)

(0.72 ± 0.87) (-/-/-)

(1.79 ± 1.83) (-/-/1)

(0.05 ± 0.08) (-/-/1)

Yoonia-Loktanellab

(0.17 ± 0.3) (-/10/28)

(0.43 ± 0.39) (2/13/62)

(0.81 ± 1.16) (1/10/69)

(1.01 ± 2.01) (1/3/24)

(0.03 ± 0.03) (-/-/7)

(0 ± 0.02) (-/-/7)

Ruegeriab

(0.17 ± 0.25) (-/14/63)

(0.35 ± 0.33) (-/6/56)

(1.04 ± 0.91) (-/-/11)

(3.57 ± 4.87) (-/-/12)

(4.15 ± 4.23) (-/-/1)

(0.18 ± 0.13) (-/-/40)

Acinetobacterb

(3.62 ± 6.39) (1/1/1)

(1.78 ± 3.52) (1/2/4)

(5.06 ± 15.95) (1/-/3)

(0.03 ± 0.03) (-/-/2)

(0.12 ± 0.09) (-/-/-)

(0.41 ± 0.31) (-/-/3)

  1. aGenus represents a core phycosphere genus
  2. bGenus represents a dominant phycosphere genus