Table 4 Average FPR and TPR by adjusted analysis on un-normalized/normalized simulated OTU tables

FPR

Corncob

0.1077

0.0498

0.0919

0.0400

-

-

-

-

DESeq2

0.0921

0.0395

0.0779

0.0312

-

-

-

-

EdgeR

0.1034

0.0415

0.0893

0.0331

-

-

-

-

LDM

0.0501

0.0096

0.0499

0.0096

0.0501

0.0096

0.0489

0.0095

Limma

0.0561

0.0128

0.0719

0.0203

-

-

-

-

Linear regression

0.0475

0.0085

0.0469

0.0083

0.0472

0.0083

0.0488

0.0098

MetagenomeSeq

-

-

-

-

-

-

0.1539

0.0759

Monocle

0.7261

0.6695

0.6493

0.5839

0.0486

0.0086

0.0501

0.0102

QRank

0.0493

0.0101

0.0499

0.0100

0.0503

0.0098

0.0496

0.0099

ZINQ-MinP

0.0483

0.0094

0.0484

0.0096

0.0488

0.0096

0.0472

0.0091

ZINQ-Cauchy

0.0533

0.0107

0.0535

0.0106

0.0539

0.0104

0.0530

0.0109

TPR

Corncob

0.4544 ^∗

0.3093 ^∗

0.4018 ^∗

0.2615 ^∗

-

-

-

-

DESeq2

0.3289 ^∗

0.2346 ^∗

0.2859 ^∗

0.1912 ^∗

-

-

-

-

EdgeR

0.4046 ^∗

0.2782 ^∗

0.3653 ^∗

0.2395 ^∗

-

-

-

-

LDM

0.3283

0.1850

0.3094

0.1677

0.3283

0.1850

0.4150

0.2700

Limma

0.3981

0.2636 ^∗

0.3701 ^∗

0.2369 ^∗

-

-

-

-

Linear regression

0.3358

0.1867

0.3030

0.1573

0.3214

0.1735

0.4080

0.2735

MetagenomeSeq

-

-

-

-

-

-

0.4900 ^∗

0.3731 ^∗

Monocle

0.8637 ^∗

0.8275 ^∗

0.8055 ^∗

0.7579 ^∗

0.3251

0.1766

0.4107

0.2761

QRank

0.3887

0.2346

0.2981

0.1641

0.3634

0.2160

0.3593

0.2117

ZINQ-MinP

0.4437

0.2733

0.3452

0.1945

0.4188

0.2535

0.4176

0.2519

ZINQ-Cauchy

0.4919

0.3156

0.3941

0.2333

0.4666

0.2943

0.4627

0.2919