Table 3 Taxonomy associated to sequences of glycoside hydrolases belonging to GH13 family (most abundant) and the enriched GH families in heavy fraction samples from SIP metagenome
GH families | Sample | Proteobacteria | Acidobacteria | Actinobacteria | Planctomycetes | Others |
GH13 | Cultivated | 66.8 (2605) | 21.8 (827) | 0.9 (36) | 0.09 (1) | 10.4 (51.4) |
GH13_SIP | Control | 20.1 (128) | 23.4 (148) | 25.6 (162) | 0.1 (4) | 31 (196) |
EPS | 17.9 (89) | 24.7 (125) | 20.4 (95) | 2.9 (13) | 34 (172) | |
Labeled | 17.2 (127) | 4 (30) | 45.7 (333) | 5.7 (42) | 27 (201) | |
GH109 | Control | 11 (22) | 45 (92) | 12 (26) | 2 (4) | 31 (68) |
EPS | 7 (19) | 26 (76) | 7 (18) | 21 (60.8) | 40 (111.6) | |
Labeled | 7 (34) | 9 (48) | 13 (62) | 29 (150) | 42 (217) | |
GH117 | Control | 0 (0) | 33 (1) | 33 (1) | 0 (0) | 33 (1) |
EPS | 0 (0) | 0 (0) | 17 (1) | 0 (0) | 38 (5) | |
Labeled | 9 (1) | 0 (0) | 27 (3) | 0 (0) | 64 (7) | |
GH50 | Control | 100 (3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
EPS | 100 (2) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
Labeled | 8 (2) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 92 (24) | |
GH32 | Control | 0 (0) | 44 (4) | 11 (1) | 0 (0) | 44 (4) |
EPS | 0 (0) | 11 (2) | 5 (1) | 5 (1) | 79 (15) | |
Labeled | 6 (2) | 14 (5) | 3 (1) | 9 (3) | 69 (24) | |
GH17 | Control | 75 (9) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 25 (3) |
EPS | 43 (3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 57 (4) | |
Labeled | 44 (8) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 56 (10) | |
GH71 | Control | 0 (0) | 0 (0) | 100 (1) | 0 (0) | 0 (0) |
EPS | 0 (0) | 25 (1) | 50 (2) | 0 (0) | 25 (1) | |
Labeled | 22 (5) | 0 (0) | 35 (8) | 0 (0) | 43 (10) |