Skip to main content

Table 3 Family-level percent bacterial composition for each of the 14 stool samples examined in this study

From: Characterizing the fecal microbiota of infants with botulism

  Confirmed samples b Non-confirmed samplesb
Phylum Family CDC68129 CDC68058 CDC69068 CDC68083 CDC68116 CDC68192 CDC68090 CDC68126 CDC68053 CDC69114 CDC68112 CDC68122 CDC69062 CDC69078
Actinobacteria Actinomycetaceae 0.0 % 0.0 % 0.1 % 0.0 % 1.0 % 2.4 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.4 % 0.0 % 0.0 %
Bifidobacteriaceae 6.1 % 0.0 % 24.6 % 4.6 % 0.0 % 0.0 % 51.9 % 53.5 % 0.0 % 0.0 % 19.3 % 0.0 % 6.7 % 48.2 %
Coriobacteriaceae 1.2 % 0.0 % 5.4 % 0.2 % 0.1 % 1.6 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 12.7 % 0.0 % 0.0 % 0.5 % 0.8 %
Bacteroidetes Bacteroidaceae 0.0 % 0.0 % 0.1 % 21.4 % 0.3 % 0.0 % 0.0 % 20.5 % 0.0 % 0.3 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 1.4 %
Rikenellaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 4.2 %
Sphingobacteriaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 15.7 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 %
Firmicutes Paenibacillaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 3.7 % 0.0 %
Planococcaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 21.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 40.2 % 0.0 %
Enterococcaceae 22.3 % 20.4 % 14.8 % 19.2 % 0.9 % 42.8 % 7.1 % 0.4 % 0.0 % 10.0 % 72.9 % 8.9 % 34.0 % 0.1 %
Lactobacillaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.3 % 1.3 % 0.0 % 0.0 % 31.4 % 0.0 % 0.6 % 69.6 % 0.0 % 0.0 %
Clostridiaceae 3.5 % 0.1 % 0.3 % 0.1 % 0.1 % 11.9 % 4.1 % 0.2 % 0.0 % 35.1 % 0.0 % 4.4 % 0.5 % 0.8 %
ClostridialesFamilyXI 0.0 % 0.0 % 3.2 % 0.0 % 0.2 % 0.4 % 0.2 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 12.1 % 0.0 %
Lachnospiraceae 0.2 % 0.0 % 0.0 % 0.2 % 0.1 % 23.0 % 0.0 % 0.8 % 0.0 % 1.1 % 0.0 % 8.3 % 1.1 % 36.1 %
Ruminococcaceae 1.3 % 0.0 % 0.0 % 0.4 % 0.1 % 0.2 % 0.0 % 0.2 % 0.0 % 0.2 % 0.0 % 0.0 % 0.5 % 3.5 %
Proteobacteria Sphingomonadaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 2.7 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 %
Comamonadaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 18.4 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.2 % 0.0 % 0.0 %
Desulfovibrionaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 4.1 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 %
Enterobacteriaceae 65.2 % 78.7 % 51.1 % 9.1 % 96.3 % 15.7 % 14.4 % 21.5 % 0.1 % 40.0 % 2.7 % 6.9 % 0.0 % 0.8 %
Pseudomonadaceae 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 68.1 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 0.0 %
Tenericutes Erysipelotrichaceae 0.0 % 0.1 % 0.0 % 1.5 % 0.1 % 0.0 % 0.0 % 2.6 % 0.0 % 0.3 % 0.0 % 0.0 % 0.0 % 1.5 %
Othera 0.1 % 0.7 % 0.5 % 2.4 % 0.5 % 0.8 % 1.2 % 0.2 % 0.4 % 0.3 % 4.3 % 1.2 % 0.7 % 2.6 %
  1. aIncludes family-level taxa that were either unassigned or represented <1.0 % abundance in each of the 14 samples
  2. bHighest percent abundance in each column recorded in bold